Плесневые грибы достаточно широко используются человеком.
Штаммы гриба Aspergillus niger применяются для производства лимонной кислоты из сахаристых веществ.
Штаммы Botrytis cinerea («благородная гниль») поражает виноград, используемый для производства некоторых вин (токай, сотерн, трокенбееренауслезе).
Другие виды плесени (т. н. «благородная плесень») используются для выделки особых сортов сыра (рокфор, камамбер).
Часто плесень поражает плодовые тела съедобных грибов и делает их непригодными для сбора. Но иногда такие грибы становятся особыми объектами грибной охоты: например, Гипомицес млечниковый (Hypomyces lactifluorum).
Из пеницилла получают лекарственное средство пенициллин.