Бактерии являются важнейшим звеном в круговороте веществ в природе. Они первыми появились на Земле, распространены повсеместно и способны к разрушению сложных органических веществ отмерших частей растений и трупов животных, а также дальнейшему их преобразованию в неорганические вещества, необходимые для питания растений.
Бактерии, обитающие в водной среде, являются природными очистителями водоёмов и сточных вод. Они перерабатывают опасные органические вещества в безопасные для всего живого неорганические. Благодаря бактериям, живущим в почвенной среде, образуется гумус и перегной.
Есть среди представителей этого царства и вредные виды, которые вызывают болезни у растений, животных и человека. Не редко некоторые из них заканчиваются летально, потому что бактерии способны приспосабливаться к различным лекарствам, в результате чего их не так просто уничтожить.